Lubelska Akademia WSEI posiada uprawnienia do prowadzenia szkoły doktorskiej oraz nadawania stopni naukowych doktora i doktora habilitowanego w dyscyplinach:
Uczelnia tworzy środowisko sprzyjające rozwojowi naukowemu, oferując doktorantom kształcenie na najwyższym poziomie i wsparcie w realizacji ambitnych projektów badawczych. Przygotowanie rozprawy doktorskiej możliwe jest zarówno w ramach stacjonarnych studiów III stopnia, jak i seminariów doktorskich w trybie eksternistycznym, przeznaczonych dla osób aktywnych zawodowo, które chcą rozwijać swoje kompetencje naukowe w elastyczny sposób. Ponadto, Lubelska Akademia WSEI daje możliwość realizacji doktoratu wdrożeniowego, który pozwala łączyć pracę badawczą z działalnością zawodową, umożliwiając zastosowanie wyników badań w praktyce gospodarczej i biznesowej. Lubelska Akademia WSEI to inspirujące środowisko dla ambitnych badaczy, w którym najwyższe standardy akademickie łączą się z nowoczesną elastycznością kształcenia, indywidualnym wsparciem promotorskich mentorów oraz możliwością prowadzenia badań o realnym wpływie na gospodarkę, innowacje i otoczenie społeczno-zawodowe.